A auditoria é um serviço essencial para a qualidade da assistência em saúde e controle de gasto para as instituições hospitalares e para os planos de saúde. Os programas ou softwares voltados para a auditoria desempenham um papel importante para o êxito do trabalho, nesse contexto a pesquisa objetiva descrever a tendência da pesquisa cientifica em relação aos softwares voltados para auditoria de saúde na área hospitalar, através das publicações levantadas nos principais sites e banco de dados, no período de 2000 a 2010, e demonstrar a tendência da pesquisa em relação ao software de auditoria em saúde na área hospitalar. A metodologia aplicada foi um estudo descritivo baseado em revisão retrospectiva da literatura no Brasil, os dados foram coletados nas bibliotecas digitais: Scielo, LILACS, BIREME, Google Acadêmico, sites de Universidades e site do Ministério da Saúde. Resultado: Publicações: artigos 20 (55,6%); manuais 12 (33,3%); trabalhos de teses/dissertação e trabalhos de conclusão de curso (TCC) 4 (11,1%). Sites: Google acadêmico 17 (47,22%); Ministério da Saúde 10 (27,78%); Scielo 6 (16,67%) e BIREME, UFSC e UFRGS (8,33%) (1 cd). Ano: 2006 10 (%); 2008 5 (%); 2003 e 2004 4 (%); 2002 e 2009 3 (%); 2001 e 2007 2 (%); 2000, 2004 e 2010 1 (%) em cada ano. Discussão: Os dados remetem uma tendência para confecção de prontuário eletrônico e o período que mais teve publicações foi motivado pelo cenário político. Conclui que o profissional auditor deverá conhecer as normas, legislação como também utilizar o prontuário eletrônico.