A compreensão das relações entre saneamento, saúde pública e meio ambiente é essencial para o planejamento dos sistemas de saneamento nas cidades. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi realizar uma avaliação do impacto da implantação do sistema público de esgotamento sanitário na qualidade da água da Bacia Hidrográfica do Rio Cachoeira, em Joinville, a qual abrange quase metade da população da cidade. Foram realizadas análises da qualidade da água em 10 pontos ao longo dos anos de 2011 a 2015, período em que foram incrementadas mais de 31.000 economias de esgoto nas sub-bacias do Rio. Para cálculo da qualidade da água utilizou-se o IQA – Índice de Qualidade da Água, padrão CETESB. De forma geral, o IQA médio do rio evoluiu de ruim para regular, fruto de uma redução no lançamento de esgoto de mais de cinco milhões de litros ao dia.