O processo de cultivo da Cannabis especificamente para a indústria farmacêutica envolve inúmeras complexidades, sendo que um dos grandes empecilhos contemporâneos é encontrar fornecedores regulares de extratos com a qualidade e padrão de composição necessários para pesquisas. O objetivo deste artigo é apresentar a relação entre a gestão de sistemas agroindustriais, o marco legal para produção de Cannabis para fins medicinais no Brasil e apontamentos para agro-oportunidades nesse âmbito a partir de prospecção tecnológica. Para tanto, desenvolveu-se um ensaio teórico com investigação da bibliografia científica recente sobre o tema e chegou-se ao resultado de pouquíssimos desenvolvimentos de pesquisa na temática específica. Conclui-se que há todo um campo de experiências práticas fundamentadas em pesquisa científica para ser desenvolvido e que as possíveis contribuições de prospecção tecnológica no âmbito dos sistemas agroindústrias podem ser de extrema valia para os stakeholders do processo.